Les Tsukumogami esprits ou marebito ayant possédé des objets anciens peuvent prendre forme humaine. Kunato Hyouma, héritier d’une illustre lignée de saenome chargés de les renvoyer paisiblement dans leur monde, les déteste depuis que sa famille a été tragiquement tuée par l’un d’eux. Pour le guérir de cette haine, son grand-père l’envoie vivre chez Nagatsuki Botan, une jeune fille cohabitant avec des Tsukumogami pacifiques qui aident les humains en traquant leurs semblables renégats.