Il y a plus d’un millénaire, alors que la planète avait été poussée au bord de la destruction par l’humanité, un génie surnommé Y entreprit de la reconstruire entièrement. Grâce à d’innombrables engrenages et mécanismes complexes, il transforma ce monde ravagé en une gigantesque machine parfaitement fonctionnelle. Depuis, on l’appelle la Clockwork Planet, la Planète Horloge. Naoto Miura, 16 ans, est un adolescent fascinée par la mécanique au point de préférer les automates aux êtres vivants. Il passe ses journées à bricoler et tente désespérément de finaliser son propre prototype. Un jour, alors qu’il est tranquillement chez lui, un étrange cercueil de verre chute littéralement du ciel et s’écrase dans son salon. À l’intérieur repose RyuZU, une automate aussi élégante que mystérieuse… et l’une des créations légendaires de Y. La rencontre entre Naoto et cette machine parfaite va bouleverser sa vie, et peut-être même le destin de la Planète Horloge.